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利用代謝組和轉錄組聯合分析 構建水稻全生育期代謝調控網絡

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日期:2021-11-09 13:55:45    來源:《中國科學報》    

近日,海南大學熱帶作物學院教授羅杰團隊在《分子植物》在線發(fā)表了題為《水稻全生育期代謝調控網絡》的研究論文。

該研究利用代謝組和轉錄組聯合分析,構建了水稻全生育期主要組織器官的代謝調控網絡,并精準識別了調節(jié)關鍵代謝產物積累的調控基因。該研究不僅對水稻基礎研究和育種實踐具有重要意義,還對其他作物全生育期代謝組學研究提供了借鑒。

該研究使用秈稻品種珍汕97和明恢63整個生命周期不同組織的樣品,結合靶向和非靶向代謝組學分析方法,共注釋并定量分析825種代謝物。結合代謝組和同一時期的轉錄組數據構建了水稻代謝調控網絡(RMRN)。

利用這個數據集,該研究成功使用兩種獨立的策略剖析了新的代謝途徑,分別是利用已知的轉錄因子作為誘餌來篩選木質素代謝新的調控網絡,以及根據組織特異性無偏見地識別新的甘油磷脂代謝調控因子。因此,該研究通過多組學手段對水稻全生育期進行了全面的代謝譜分析,其大數據資源也將促進水稻生長調控、抗性和營養(yǎng)品質方面的改良研究。(溫才妃 李天暢)

關鍵詞: 科研人員 水稻 全生育期代謝調控網絡 水稻全生育期

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