近日，中國(guó)工程院院士、廣東省科學(xué)院微生物研究所名譽(yù)所長(zhǎng)吳清平團(tuán)隊(duì)完成了白肉靈芝的全基因組測(cè)序。據(jù)悉，這是世界上首次對(duì)白肉靈芝的基因組進(jìn)行組裝和注釋。相關(guān)研究發(fā)表于《G3：基因，基因組，遺傳學(xué)》。
白肉靈芝是在中國(guó)發(fā)現(xiàn)的靈芝科一新種，具有多種藥理活性。作為我國(guó)具有鮮明地域特色的野生資源，白肉靈芝目前已成為科技扶貧和帶動(dòng)一方經(jīng)濟(jì)發(fā)展的重要資源，在中國(guó)西南地區(qū)廣泛種植。但由于缺乏參考基因組，其遺傳研究受到了阻礙。
研究人員從一個(gè)單核菌株中提取了高質(zhì)量的DNA，并基于Illumina和Nanopore平臺(tái)組裝完成第一個(gè)白肉靈芝全基因組。組裝的基因組大小為50.05Mb，N50為3.06Mb，預(yù)測(cè)到78206條編碼序列和13390個(gè)基因。
此外，研究人員分析了白肉靈芝和靈芝之間次級(jí)代謝產(chǎn)物(萜類(lèi)化合物)的功能基因的差異。研究發(fā)現(xiàn)，與靈芝相比，白肉靈芝具有更多與萜類(lèi)化合物合成相關(guān)的基因，這可能是它們表現(xiàn)出不同生物活性的原因之一。
據(jù)吳清平團(tuán)隊(duì)成員胡惠萍介紹，白肉靈芝基因組是目前組裝質(zhì)量最好的靈芝屬物種。該成果為今后特定物種的高原適應(yīng)性深層研究奠定了基礎(chǔ)。(記者 朱漢斌 通訊員 李誠(chéng)斌)
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