科技日報記者 張夢然
在2日發(fā)表于英國《自然·遺傳學》雜志上的一項研究中，安進 (Amgen)制藥屬下deCODE基因公司的科學家們展示了通過結(jié)合序列多樣性和RNA表達的數(shù)據(jù)，測量出群體規(guī)模血漿中大量蛋白質(zhì)的水平，以深入了解人類疾病和其他表型。
deCODE基因公司的科學家們使用了血漿中的5000種蛋白質(zhì)，這些蛋白質(zhì)以群體規(guī)模的多重平臺為目標，以解開它們的遺傳決定因素以及它們與人類疾病和其他特征的關系。
利用技術平臺“SOMAscan”的蛋白質(zhì)組學測定法測量的血漿蛋白質(zhì)水平，deCODE基因公司的科學家們測試了2700萬個序列變異與35559名冰島人血漿中4719種蛋白質(zhì)水平的關聯(lián)。他們發(fā)現(xiàn)了18084個序列變異與蛋白質(zhì)水平之間的關聯(lián)，其中19%與通過全基因組測序確定的罕見變異相關?？傮w而言，93%的關聯(lián)是新穎的。此外，他們分別基于“SOMAscan”方法和基于抗體的OLINK精準蛋白質(zhì)組學分析，從現(xiàn)有最大的血漿蛋白質(zhì)組學研究中重復了83%和64%的報告關聯(lián)。
科學家們測試了血漿中蛋白質(zhì)水平與373種疾病和其他特征的關聯(lián)，并產(chǎn)生了257490個這樣的關聯(lián)。他們整合了序列變異與蛋白質(zhì)水平、疾病和其他特征的關聯(lián)，發(fā)現(xiàn)已報告的與疾病和其他特征相關的大約5萬個變異中的12%，也與蛋白質(zhì)水平相關。
deCODE基因公司首席執(zhí)行官、該論文的資深作者之一凱瑞·斯蒂凡森表示，蛋白質(zhì)組學可以幫助解決遺傳研究中的一個主要難題：確定哪個基因負責序列變異對疾病的影響。此外，蛋白質(zhì)組還提供了一些時間相關的測量方法，因為血液中的蛋白質(zhì)水平會隨著事件發(fā)生和發(fā)生的時間而上升和下降。
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