中國農(nóng)科院茶葉研究所茶樹遺傳育種團(tuán)隊基于“龍井43”基因組參考序列和茶樹重測序數(shù)據(jù)，開發(fā)出一款200K茶樹SNP(單核苷酸多態(tài)性)芯片。相關(guān)研究成果近日發(fā)表于《植物生物技術(shù)雜志》。
該芯片是首款茶樹高密度SNP芯片，以“龍井43”(雌性)和“白毫早”(雄性)F1群體為材料，能將18226個SNP位點繪入圖譜，獲得5325個bin-marker，連鎖圖譜總長度為2107.01厘摩，相鄰標(biāo)記平均遺傳圖距為0.39厘摩，構(gòu)建了目前遺傳密度最高的連鎖圖譜。
實驗驗證表明，該芯片可以有效定位關(guān)鍵QTL位點，發(fā)掘茶樹重要功能基因。利用其對不同茶樹品種的SNP分型研究，發(fā)現(xiàn)茶樹大葉種和小葉種之間的兩個強(qiáng)選擇位點，對揭示茶樹品質(zhì)調(diào)控關(guān)鍵基因和兩個變種間的進(jìn)化關(guān)系具有重要意義。(記者 李晨 通訊員 張璐君)
關(guān)鍵詞： 茶樹高密度單核苷酸多態(tài)性芯片 茶樹 關(guān)鍵QTL位點 SNP芯片
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