科技日報(bào)記者 馬愛平 通訊員 金云翔 艾超
近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所植物營養(yǎng)團(tuán)隊(duì)研究提出土壤微生物群落定量研究優(yōu)化策略。相關(guān)成果發(fā)表在《土壤生物學(xué)與生物化學(xué)》（Soil Biology & Biochemistry）上。
相對定量（RMP）和絕對定量（AMP）方法對微生物群落結(jié)構(gòu)分析的差異 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所供圖
微生物群落的組成和功能在人類健康、全球元素循環(huán)、作物生長和植物抗病中發(fā)揮關(guān)鍵作用。隨著高通量測序等技術(shù)的革命性突破，極大地增加了我們對微生物多樣性、群落結(jié)構(gòu)和物種組成的認(rèn)識。然而，測序數(shù)據(jù)僅提供微生物群落的相對豐度變化，忽略了微生物絕對數(shù)量的變化規(guī)律。針對高通量測序數(shù)據(jù)的這一缺陷，研究人員已經(jīng)開發(fā)出多種微生物絕對豐度定量方法，例如，內(nèi)參法(spike-AMP)、 熒光定量法與高通量測序結(jié)合(qPCR-AMP)、 流式細(xì)胞儀與高通量測序結(jié)合(FCM-AMP)等。然而，這些定量方法的普遍適用性和精確度尚不清楚。
研究團(tuán)隊(duì)利用采自黑龍江海倫和海南三亞的兩類差異較大的土壤樣品，評估了土壤微生物研究中最常用的兩種絕對定量方法內(nèi)參法和熒光定量法與高通量測序結(jié)合的方法。結(jié)果表明：內(nèi)參法在準(zhǔn)確性、穩(wěn)定性和工作量等方面沒有顯示出任何優(yōu)勢。相比之下，更常用的熒光定量法與高通量測序結(jié)合的方法對探究環(huán)境擾動(dòng)對土壤微生物動(dòng)力學(xué)的影響提供了有價(jià)值的見解?？紤]其穩(wěn)定性和技術(shù)可行性，熒光定量法與高通量測序結(jié)合方法可廣泛應(yīng)用于土壤微生物群落的定量研究。
該研究得到國家自然科學(xué)基金、中國科協(xié)青年托舉計(jì)劃等項(xiàng)目資助。
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