通訊員 左彥 科技日報(bào)記者 代小佩
3月17日，首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院胃腸肝膽腫瘤外科彭吉潤教授課題組和北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心張澤民教授課題組合作，在國際期刊《腫瘤細(xì)胞》（Cancer Cell）上在線發(fā)表研究論文，解析了腫瘤免疫微環(huán)境形成因素。
腫瘤微環(huán)境特征與免疫檢查點(diǎn)抑制劑的治療效果密切相關(guān)，系統(tǒng)解析腫瘤微環(huán)境中不同免疫細(xì)胞的表型，是理解腫瘤發(fā)生、發(fā)展機(jī)理以及提高免疫治療效果的關(guān)鍵。上述研究以結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移為模型，利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)系統(tǒng)研究了腫瘤微環(huán)境如何形成這一問題，并給出了新認(rèn)識、新見解。
該研究中，課題組收集了一組未經(jīng)治療的結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移患者包括原發(fā)腸癌及癌旁組織、肝轉(zhuǎn)移癌及癌旁組織、腸系膜淋巴結(jié)和外周血在內(nèi)的配對樣本，對32萬3千多個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了10x Genomics測序，同時(shí)還對5000多個(gè)細(xì)胞采用Smart-seq 2方法進(jìn)行了測序驗(yàn)證。通過整合多種scRNA-seq平臺的表達(dá)譜數(shù)據(jù)和T細(xì)胞受體序列測序結(jié)果，研究人員構(gòu)建了結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移患者多種組織的高分辨率免疫細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜，并為后續(xù)相關(guān)研究工作提供了極有價(jià)值的數(shù)據(jù)資源。
為了量化分析腫瘤細(xì)胞成分和駐留組織/器官生境對各種免疫細(xì)胞不同表型的影響，研究人員設(shè)計(jì)了一種被稱為PhenoAligner的算法，表型顯著受到惡性腫瘤細(xì)胞影響的免疫類群被定義為M-type，而表型顯著受到組織/器官生境影響的免疫類群則被定義為N-type。研究人員還識別出多種與腫瘤進(jìn)展或轉(zhuǎn)移相關(guān)的關(guān)鍵性免疫細(xì)胞。此外，研究人員鑒定出三群分別高表達(dá)SPP1、C1QC和MKI67的腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞。
關(guān)鍵詞： 腫瘤免疫
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