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海洋中發(fā)現(xiàn)超5000種新RNA病毒

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日期:2022-04-13 05:31:53    來源:科技日?qǐng)?bào)    

科技日?qǐng)?bào)實(shí)習(xí)記者 張佳欣

美國俄亥俄州立大學(xué)微生物學(xué)家從世界各地收集的海水樣本中發(fā)現(xiàn)了5000多種新RNA病毒,并將它們歸類的門的數(shù)量從5種增加到10種。這一有關(guān)RNA病毒的新數(shù)據(jù)寶庫擴(kuò)大了生態(tài)研究的可能性,并重塑了人們對(duì)這些小而重要的亞微觀粒子如何進(jìn)化的理解。相關(guān)研究論文發(fā)表在近日的《科學(xué)》雜志上。

研究團(tuán)隊(duì)收集了海水樣本,并通過搜索編碼RNA依賴的RNA聚合酶(RdRp)的基因?qū)λ鼈冞M(jìn)行了病毒RNA測(cè)序。該團(tuán)隊(duì)隨后使用超級(jí)計(jì)算機(jī)和機(jī)器學(xué)習(xí)算法為RNA病毒建立了系統(tǒng)發(fā)育樹,共發(fā)現(xiàn)了5504種新的海洋RNA病毒,并將已知RNA病毒門的數(shù)量從5個(gè)增加到10個(gè)。

研究人員將新發(fā)現(xiàn)的病毒歸入五個(gè)新提出的門。從地理上繪制這些新序列顯示,其中兩個(gè)新門數(shù)量特別豐富。

研究人員相信,新發(fā)現(xiàn)的5個(gè)病毒門的一個(gè)可能是研究人員長期以來一直在尋找的RNA病毒進(jìn)化中缺失的一環(huán),它將兩個(gè)已知的RNA病毒分支連接起來,這些分支在復(fù)制方式上存在分歧。這一發(fā)現(xiàn)填補(bǔ)了病毒進(jìn)化歷史中缺失的部分空白。

研究人員說,更多地了解世界海洋中的病毒多樣性和豐度將有助于解釋海洋微生物在海洋適應(yīng)氣候變化中的作用。海洋吸收了大氣中人類產(chǎn)生的二氧化碳的一半,該小組之前的研究表明,海洋病毒是生物泵上的“旋鈕”,影響海洋中碳的儲(chǔ)存方式。

此外,這些新病毒不僅有助于科學(xué)家更好地了解RNA病毒的進(jìn)化歷史,還有助于了解地球上早期生命的進(jìn)化。

正如新冠疫情大流行所展現(xiàn)出來的一樣,RNA病毒會(huì)導(dǎo)致致命的疾病。但RNA病毒在生態(tài)系統(tǒng)中也發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,因?yàn)樗鼈兛梢愿腥緩V泛的生物體,包括動(dòng)物、植物和微生物。繪制出這些RNA病毒生活在世界上的哪個(gè)位置有助于闡明它們?nèi)绾斡绊戲?qū)動(dòng)地球上的許多生態(tài)過程的生物體。該研究還可幫助研究人員隨著基因數(shù)據(jù)庫的增長對(duì)新病毒進(jìn)行分類。

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